据央视专题片《巡视利剑》报道，2014年中央巡视组对甘肃省开展巡视时，虞海燕时任甘肃省委常委、兰州市委书记。当时，，巡视结束后，中央纪委对巡视移交问题线索展开调查。”

2015年起，他指使下属采取虚构工程项目的方式，伪造工程合同及验收报告，并令人冒用他人身份先后注册成立了两家“皮包”公司，专门用于虚开建筑类发票，总共套取财政和扶贫发展专项资金518万余元，其中扶贫资金90余万元。在套取资金的同时，他还以乡财政资金困难为由，13次从乡代理办违规挪用村级集体资金和村民互助资金435.2万元，其中最多一次，挪用资金高达80万元。

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